コミスタ、クリスタでのトーン貼り付け機能以外の場合、モアレが発生する可能性が高くなります。
コミスタ、クリスタでも完全に防ぐことはできないのですが、今回は省略します。
フォトショップ、SAI等のお絵かきソフトの場合は特に注意が必要になります。

■モアレとは
以下のサイトがわかりやすいため、参照
モアレについて

■トーン画像を使用する場合
・等倍のまま使用する
・可能であれば、レイヤーを2値（SAI）・2階調（フォトショップ）で原稿を作成する
・斜めにせずに使用する